A.
届出機能は、実際の打刻時間にかかわらず、届出申請した出勤・退勤時刻で上書きされる仕組みです。
実際の打刻時間で計算させるためには、届出申請時のフォームには出勤・退勤時刻を未入力で申請・承認してください。
そもそも未入力で運用する場合、システム管理＞申請区分 設定にて初めから出退勤時刻欄を非表示で設定いただくとよろしいかと存じます。

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