A.
振替休日・代休には「マイナス可・マイナス不可」の設定があります。

※振替休日と代休の性質上デフォルト設定は以下です。
・振替休日：マイナス可
・代休：マイナス不可

●マイナス可の場合
対応する「休日出勤」「振替出勤」がなくても先行して休暇を取得できる設定です。
残数がゼロでも、休暇をマイナス利用できます。

●マイナス不可の場合
対応する「休日出勤」「振替出勤」がない場合休暇が取得できない設定です。
残数がゼロの場合、休暇を利用できません。

ご参考：
有給休暇等の初期設定方法は？