A.

表示されるデータに違いはありません。
打刻や日次勤怠などの機能も同じです。どちらから打刻・修正してもデータはひとつとなります。

違いがあるとすれば、システム管理者が利用する「システム管理機能」についてはスマホアプリには表示されません。「システム管理機能」でシステムの設定を変更する場合は、スマホの表示モードをPCにしていただくか、ブラウザで開いていただく必要があります。