A.

上記の処理はできない仕様です。
（例えば、扶養控除申告書のみ収集し他書類を収集しない等の処理はできません。）
保険料控除の申告が無い社員についても、空欄にて保険料控除申告書を作成・収集する仕様となります。

また、年末調整の対象となる人の要件に、確定申告を行うか否かは含まれておりません。

【参考】
No.2665 年末調整の対象となる人（国税庁HP）

確定申告を行う人の年末調整の仕方や、申告書類の収集について不明点がある場合は、管轄の税務署へお問い合わせください。