A.

勤務区分の設定に原因があると予想されるため［システム管理＞勤務区分］より、対象の勤務区分（「代休」）をご確認ください。
勤務区分「代休」の「勤務/休日・休暇」項目において、「休日・休暇」ではなく「勤務」の設定になっている可能性があります。「勤務/休日・休暇」項目を「休日・休暇」に設定し、「代休日数」の項目で「1」を選択していただければ問題が解消されます。