A.

勤務区分の設定が原因で、休憩時間がうまく設定できていないことが考えられます。
[上部メニュー「システム管理」＞サイドメニュー「勤務区分」] 画面の、深夜勤務用の勤務区分の設定において、休憩時間の「翌日」にチェックが入っているかどうかをご確認ください。

（例）
勤務　4月1日19:00 〜 4月2日7:00
休憩　4月2日 2:00 〜 4月2日4:00

■「翌日」チェックあり
勤務　4月1日19:00 〜 4月2日7:00
休憩　4月2日 2:00 〜 4月2日4:00

■「翌日」チェックなし
勤務　4月1日19:00 〜 4月2日7:00
休憩　4月1日 2:00 〜 4月1日4:00