A.

※パートタイマーであっても条件によっては有給が発生しますので「パートだから有給を与えない」という運用は一度社会保険労務士にご確認ください。

パート従業員に日次勤怠編集で有給を選択できないようにさせるためには、
[システム管理＞社員]の該当社員の編集画面を開き、
「勤務区分」の項目で「有給休暇」にあたる勤務区分からチェックを外します。
このチェックを外すことで、日次勤怠画面や届出申請画面で有給休暇の選択肢が表示されなくなります。